和高中溫相比，低溫冷庫特別是溫度低于-40℃以下運行的系統，出現故障往往更頻繁。正如美國供熱、制冷與空調工程師學會參考手冊中指出“一般地說，在一40℃以下的低溫運行，需要與使用一般制冷壓縮機多少有些不同的特殊技術”。

低溫運行時必須遵循以下七條操作規程：

(1)盡可能采用最適當的冷凝介質；

(2>確保系統中沒有不凝性氣體；

(3)無論是從蒸發器，還是從多級壓縮級與級之間吸入冷庫壓縮機的氣體，其溫度都應盡可能低；

(4)盡量提高壓縮機和它的吸、排氣閥的效率；

(5)采用多級壓縮系統；   

(6)采用分油效果好的油分離器；

(7)如果其它措施都無效，就降低壓縮機的轉速，如果減速后制冷能力不足，應另行選用較大的機組。